Irkutsk được đặt theo tên của sông Irkut, tên của nó bắt nguồn từ tiếng Buryat và được sử dụng như một từ đồng nghĩa giữa các bộ lạc địa phương như Yrkhu, Irkit, Irgit và Irgyt. Thành phố trước đây được gọi là "Yandashsky" theo tên của lãnh đạo người Tuva địa phương Yandasha Gorogi.

Cách đánh vần cũ của tên của thành phố là «Иркуцкъ». Trước cuộc cách mạng, thành phố được gọi là "Đông Paris", "Siberian Petersburg", "Siberian Athens". Người dân địa phương thích nghĩ về thành phố của họ là "giữa trái đất".